วิธีการทำจุลินทรีย์นั้นเกิดจากการหมักส่วนผสมดังต่อไปนี้ 1.เศษพืชหรือเศษอาหาร 30 กิโลกรัม 2.กากน้ำตาล 10 ลิตร 3.สารเร่งพ.ด.6 1 ซองของกรมพัฒนาที่ดิน สามารถขอรับได้ที่กรมพัฒนาที่ดิน หมักส่วนผสมทั้งหมดทิ้งไว้เป็นเวลาประมาณ1 เดือนก็จะได้จุลินทรีย์ที่สามารถเอามาใช้ในการทำความสะอาด
วิธีใช้จุลินทรีย์ในการทำความสะอาดเริ่มต้นจากผสมจุลินทรีย์กับน้ำสะอาดโดยมีอัตราส่วน 50 ซีซี ต่อน้ำ 20 ลิตร ฉีดล้างและทำความสะอาดคอกหมูและบริเวณรอบ ๆ และใช้จุลินทรีย์ในการทำความสะอาดและกำจัดกลิ่นตัวของหมูโดยหลังจากอาบน้ำทำความสะอาดตัวหมูเสร็จแล้ว ใช้จุลินทรีย์ผสมน้ำในอัตราส่วนเท่าเดิม ฉีดทิ้งไว้ทั่วทั้งตัวหมูประมาณ5 นาที จากนั้นล้างออกด้วยน้ำสะอาดเท่านี้ก็สามารถเลี้ยงหมูได้ถูกสุขลักษณะ ไม่ส่งกลิ่นเหม็น
